新海园1987届校友、北大生命科学学院研究员、博导魏文胜研究组再次报道长非编码RNA的功能性筛选新方法 ...

来自北京大学生命科学学院消息，新海园1987届校友、北大生命科学学院研究员、博导魏文胜研究组在Nature Biotechnology杂志在线发表了题为“Genome-wide screening for functional long noncoding RNAs in human cells by Cas9 targeting of splice sites”的研究论文。

魏文胜研究组与合作者之前率先建立了通过成对gRNA（pgRNA）在基因组中产生大片段删除的策略来对lncRNA进行高通量功能性筛选（Zhu et al. Nature Biotechnol 2016）。后续又有报道通过CRISPRi（Liu et al. Science 2017）以及CRISPRa（Joung et al. Nature 2017）等方法来进行lncRNA的高通量功能性筛选。为了突破以上方法上的局限，魏文胜研究组设计了新的筛选策略，构建了特异性靶向基因的剪接位点的新型CRISPR文库，以高通量的方式产生基因的外显子缺失或者内含子滞留。运用这一策略，实现了全基因组水平上对于lncRNA功能的高效筛选。这一新型高通量技术平台的建立，首次真正实现了从全基因组水平对长链非编码RNA进行基于完全敲除的高通量筛选，该方法学将为系统发现和解析lncRNA功能提供有效的工具。

该研究于11月5日在线发表于Nature Biotechnology（DOI: 10.1038/nbt.4283）。魏文胜研究组的博士生刘莹（CLS 14级）、曹中正（CLS 15级）、王轶楠（CLS 13级）以及博士后郭昱博士为该论文共同第一作者。该研究项目得到了国家自然科学基金重点项目、北京未来基因诊断高精尖创新中心和北大-清华生命科学联合中心的基金支持。

在2016年10月31日，魏文胜研究组曾报道长非编码RNA的高通量功能性筛选新方法，并在线发表于Nature Biotechnology（Genome-scale deletion screening of human long non-coding RNAs using a paired-guide RNA CRISPR–Cas9 library），在学界引起了轰动。北京大学生命科学学院博士研究生朱诗优（PTN12级）和哈佛大学公共卫生学院博士后李炜为该论文共同第一作者，魏文胜和刘小乐教授为共同通讯作者。

【校友链接】

魏文胜，新海园1987届校友。1981年9月，进入新海中学就读初中，而后考入高中部学习。1987年高中毕业后，考入北京大学生物化学专业，后进入美国斯坦福大学进一步深造。现任北京大学生命科学学院、北京大学生物医学前沿创新中心、北京大学-清华大学生命科学联合中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员，博士生导师。曾获拜耳学者奖、罗氏中国青年学者奖、北京大学通化东宝生命科学奖、北京大学生命科学学院最受学生欢迎奖等。

实验室研究领域：

真核基因组编辑及高通量功能基因组学，疾病与感染的分子机制。

着重发展和应用基因组编辑技术，涵盖编码及非编码序列的高通量功能基因组学、生物动态光学成像以及精准医疗。在此基础上，特别关注宿主细胞参与病原微生物感染的分子机制，为发展宿主导向的治疗手段提供新的药物靶点和思路。

 （该文摘选自“北大生科”微信公众号，更多资讯可关注其微信公众号。） 

信息出自：魏文胜实验室

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